A、图中同源染色体的两条非姐妹染色单体之间发生了交叉互换，A错误；B、B与b是一对等位基因，它们的分离仅发生在减数第一次分裂后期，B错误；C、由于发生交叉互换，等位基因A与a的分离不只发生在减数第一次分裂后期，也发生在减数第二次分裂后期，C错误；D、由于发生交叉互换，等位基因A与a的分离不只发生在减数第一次分裂后期，也发生在减数第二次分裂后期，D正确．故选：D．
