一、2016营改增自建厂房进项税能抵扣。
二、按照国家税务总局15号公告《关于发布<不动产进项税额分期抵扣暂行办法>的公告》的规定，增值税一般纳税人2016年5月1日后取得并在会计制度上按固定资产核算的不动产，以及2016年5月1日后发生的不动产在建工程，其进项税额应按照本办法有关规定分2年从销项税额中抵扣，第一年抵扣比例为60%，第二年抵扣比例为40%。其中，纳税人新建、改建、扩建、修缮、装饰不动产，属于不动产在建工程。
因此，如果纳税人2016年5月1日后购进货物和设计服务、建筑服务，用于新建不动产，上述进项税额中，60%的部分于取得扣税凭证的当期从销项税额中抵扣；40%的部分为待抵扣进项税额，于取得扣税凭证的当月起第13个月从销项税额中抵扣。
购进时已全额抵扣进项税额的货物和服务，转用于不动产在建工程的，其已抵扣进项税额的40%部分，应于转用的当期从进项税额中扣减，计入待抵扣进项税额，并于转用的当月起第13个月从销项税额中抵扣。
值得注意的是，在施工现场修建的临时建筑物、构筑物，其进项税额不适用上述分2年抵扣的规定。
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